azalia sanatorium szczawno zdrój

Najbardziej akceptowany model komunikacji CRE polega na bezpośredniej interakcji CRE z promotorem genu poprzez bliskość przestrzenną w pętlach chromatyny (22). Badaliśmy tutaj inną rodzinę z autosomalnym dominującym BDE i zrównoważoną translokacją t (4; 12) (q13.2-13.3; p11.2). Genomowe zakłócenie CRE wywołane przez translokację spowodowało represję PTHLH i doprowadziło do BDE w obu rodzinach translokacyjnych. Przeanalizowaliśmy natywne PTHLH CRE i ustaliliśmy, w jaki sposób zostały zmienione. Odkryliśmy, co uważamy za powieść CRE, która działa zarówno w cis, jak iw trans. W tym CRE istnieje lncRNA, który był kluczowy dla jego funkcji. Wiadomo, że lncRNA są ważne dla programów rozwojowych i sieci genów supresorowych guza (23). Obserwowaliśmy wzajemny gen i regulację lncRNA, które zapewniają systematyczny i kombinatoryczny obraz tego, jak wzmacniacze kodujące lncRNA mogą wpływać na ekspresję genów w normalnym rozwoju. Dysfunkcja CRE i jej lncRNA spowodowała chorobę Mendla. Wyniki Charakterystyka molekularna t (4; 12) (q13.2-13.3; p11.2). Przeanalizowaliśmy rodowód demonstrujący dziedziczenie autosomalnie dominujące. Roentgenogramy były diagnostyczne dla BDE (odniesienie 3, ryc. 1A i Suplementowe ryc. 1, A i B, materiał uzupełniający dostępny online w tym artykule; doi: 10.1172 / JCI65508DS1). Osoby dotknięte chorobą wykazywały niski wzrost (mniej niż trzeci percentyl). Widoczne było względne skrócenie kończyn w porównaniu do tułowia. Współczynnik rozpiętości ramion / wysokości został zmniejszony (Tabela uzupełniająca 1). Klingotypowanie o wysokiej rozdzielczości wykazało translokację zrównoważoną t (4; 12) (q13.2-13.3; p11.2) (ryc. 1A). Mutacje HOXD13 i PTHLH związane z BDE zostały wykluczone przez sekwencjonowanie (5, 24). Sekwencjonowanie specyficzne dla allelu punktu zatrzymania zidentyfikowało pochodną chromosomu 4 [der (4)] punkt przerwania 145 460 bp za PTHLH w pozycji 28 147 744 bp (zespół UCSC hg18). Punkt przerwania wynosił 45,433 bp za wcześniej opisanym punktem przerwania der (8) w t (8; 12) (q13; p11.2) (4). Mikrodelecje i insercje pseudogenu 7SL w punktach przerwania nie eliminowały ani nie tworzyły miejsc wiązania czynnika transkrypcji (TFBS, Suplementowa Figura 1, E i F). Aby skupić się na chondrogennej funkcji PTHLH, indukowaliśmy różnicowanie chondrogenne w fibroblastach chorego pacjenta i 2 niespokrewnionych kontrolnych. Za pomocą ilościowego RT-PCR zaobserwowaliśmy regulację w dół PTHLH (P = 0,04) i jej dalszych celów, ADAMTS-7 i ADAMTS-12 (Suplementowa Figura 1, G i H). PTHLH był obniżony, a jego niedobór korelował z BDE u dotkniętych członków rodziny. Rycina Translokacja t (4; 12) (q13.2-13.3; p11.2) i schemat metody 6C. (A) Translokacja z der (4) i der (12). Roentgenogram dłoni, szczególnie skrócone kości śródręcza z cyfr 4 i 5, są diagnostyczne dla BDE. (B) 6C. Usieciowano chromosynę usieciowaną formaldehydem z chondrocytów C28 / I2. Po ChIP, chromatynę naprawiono na końcu tępym i poddano ligacji przy ultrawysokim rozcieńczeniu w celu faworyzowania wewnątrzcząsteczkowych zdarzeń ligacji. Pętle chromatyny poddano amplifikacji PCR z odwrotnymi oligonukleotydami, a amplikony subklonowano i zsekwencjonowano. Promotory PTHLH i SOX9 były sekwencjami przynęty. (C) Przykład PTHLH 6C. Wprowadzono kilka pz w wyniku końcowej naprawy fragmentów chromatyny. Sekwencja oddziałująca znajdowała się na 52431,496 bp na chromosomie 12 (pozycje w pz, zespół UCSC hg18). W przypadku trans w SOX9 6C. Oddziałujący element na chromosomie 12 zidentyfikowano obok sekwencji przynęty promotora SOX9. (D) Odczytywana jest restrykcyjna klasyfikacja sekwencji 6C. Zliczono promotor (przynętę) lub interakcję promotora z dowolną sekwencją. (E) Ekspresja mRNA PTHLH i SOX9 w ludzkim C28 / I2 i LCL. Identyfikacja domniemanych CRE dla PTHLH i SOX9 techniką 6C
[patrz też: calmapherol, klasyfikacja icd 10, kregozmyk ]